1、申请条件不同：申请保障性住房不受收入和资产限制，经济适用房受到收入与资产的限制。

2、申请对象不同：经济适用住房的申请对象是低收入住房困难家庭，保障性住房的申请对象是非低收入无住房家庭。

3、申请经济适用住房的家庭应申报收入和资产，并应符合家庭收入和资产控制标准。经济适用住房和保障性住房的价格组成不同，即对低收入家庭和非低收入家庭实行不同的销售价格。

4、价格不同：保障性住房售价中包含基准地价，价格高于经济适用房，转让时经济适用房原购买价格与相应地段社会保障性住房上市交易指导价差价的90%向政府缴交增值收益，而保障性住房仅需向政府缴交60%的增值收益。

申请保障性住房后还能买房吗

1、申请家庭成员通过购买、继承、受赠等途径，在本市拥有其它住房的，应当退出保障性商品房。未退出保障性商品的，不动产登记机构不予办理其他住房(继承、受赠部分产权除外)的购房合同备案或权属登记手续。

2、保障性商品房只能自住，不得出租，不得用于经营，不得违规转让。

3、保障性商品房自销售合同约定的房屋交付时间起未满5年的，不得上市转让，不得转为普通商品房，购房家庭可向市住房保障行政管理部门或其指定机构申请回购，按原购房价折旧回购，年折旧率按1.43%执行。

4、保障性商品房自销售合同约定的房屋交付时间起满5年，且已办理不动产权属登记的，可上市交易，但应按原购房价格和上市交易时房屋市场指导价的差价的55%，向政府缴交土地收益等相关价款。