1、出让方式不同。自建房屋的土地来源是划拨或低价出让，而商品房开发商取得土地是通过出让方式。

2、产权不同。很多自建房是不具备完全产权的，具有完全的房屋所有权，但不一定具备完全的土地使用权。而商品房是具备完全产权，完全的房屋所有权和完全的土地使用权。

3、质量不同。自建房往往建设利润有限，因此，自建房的建设一般不如商品房。

4、交易限制不同。农村宅基地使用权的主体仅限于本集体经济组织成员，向本集体经济组织以外的农村居民转让农村住房和宅基地的，因违反了集体经济组织的成员权属性，应当认定无效。一般商品房在符合当地政府相关地方政策的约束的情况下，是可以进行交易的。

5、建筑成本不同。商品房开发商需要从中赚取利润，自建房就是不需要的，商品房的房价都是根据地价加预计的利润来制定的，自建房是农村的宅基地建房，只需要给工人的工资和建房材料的钱就可以了。

不是的。因为自建房所在的宅基地，是划分在集体中的，即便是出让之后，也不能将其归类为商品房范围内。而且对于农村自建房出让也不是那么容易的，申请所有权转移登记时，若是受让人不是该集体经济中的组织成员，就不允许登记